Esa manguera se llama manguera de relleno y es normal que por ahí circule agua, lo que no es normal es que no esté conectada pues esta es la encargada de llenar la taza con el agua adecuada para generar el tapón de olor y así evitar que los gases del alcantarillado salgan a la superficie por el inodoro, si ves que la manguera esta desconectada esta debe ir desde la válvula de admisión (por donde entra el agua al estanque) hacia la válvula de descarga(por donde cae el agua hacia la taza desde el estanque)